甲、乙两公司于2006年10月签订了一份合同，A市的甲公司从乙公司购买一套水处理设备。双方在合同中约定了争议解决条款；凡因履行本合同发生的一切争议，均应由双方协商解决；双方协商解决不厂的，任何一方均可向“甲公司所在地的仲裁机关申请仲裁”。甲公司于 2006年12月自行派车运回了全套没备，当即安装调试，虽发现存在质量问题，但于2007年1月按期交付了货款。2007年3月，甲公司欲向A市仲裁委员会申请仲裁，要求退款。
基于以上案情，请回答下列以下问题：
如果甲公司就该合同纠纷向A市仲裁委员会申请仲裁，乙公司对仲裁条款的效力有异议，请求人民法院确认仲裁条款无效并就该合同纠纷起诉，则下列说法正确的是：( )。
A．乙公司应向A市中级人民法院提出申请
B．乙公司应向A巾甲公司所在的区法院提出申请
C．人民法院受理乙公司的申请后应当通知A市仲裁委员会中止仲裁
D．如果人民法院裁定该仲裁协议无效后，甲公司拒不应诉的，人民法院可以缺席判决
