ABC会计师事务所2009年11月首次接受委托对甲股份有限公司(以下简称甲公司)2009年度财务报表进行审计。2010年3月8日，甲公司管理层签署了财务报表，预定 3月10日公布2009年度财务报表。在审计过程中遇到下列问题，请根据题目要求进行简要回答。
(1) 甲公司2008年度财务报表系由XYZ会计师事务所审计，并于2009年3月5日出具了保留意见审计报告。请指出为了确定甲公司2009年度财务报表的期初余额是否不存在重大的错报漏报，注册会计师应实施的主要审计程序。
(2) 2009年10月，甲公司因涉嫌侵权被乙公司起诉，由于案情复杂至资产负债表日甲公司无法作出合理的估计。2010年3月1日法院作出宣判甲公司败诉，应赔偿乙公司500万元损失；甲公司于2010年3月6日提出上诉，至财务报表公布日法院尚未作出判决，因此，甲公司对该诉讼也未作出任何处理。请指出注册会计师针对该情况应提出的处理建议；若甲公司接受注册会计师所提出的处理建议，注册会计师能否签发标准无保留意见的审计报告，并说明理由。
(3) 2010年3月9日，在甲公司公布2009年度财务报表后，注册会计师在查阅甲公司与年度财务报表一同披露的经营报告时发现对一项对外投资业务的解释与已经公布的财务报表不一致，注册会计师经过核查，确定为甲公司已审财务报表有误，因此，注册会计师提请甲公司管理层修改财务报表。如果甲公司同意并于当日修改了财务报表并于当日重新批准报出，注册会计师应如何处理如果甲公司拒绝修改财务报表，且注册会计师尚未提交审计报告，注册会计师应采取的措施
