甲房地产开发公司，在A市取得5万平方米土地开发权，缴纳土地出让金0.3亿元，土地开发成本4.7亿元，其中0.5亿元为安置动迁用房。甲企业由于资金紧张，向乙房地产开发公司购置的0.5亿元动迁用房没有及时付款，经甲、乙双方协商，甲公司把1万平方米土地开发权转让给乙公司，作价金额为1.2亿元，除抵扣0.5亿元房款外，乙企业再向甲企业提供0.7亿元的建筑用材料，甲企业对剩余的4万平方米土地进行了开发，建造商民两用楼共计建筑面积50万平方米，除乙企业提供0.7亿元材料款外，甲企业又投入房产开发成本10亿元，房地产开发费用2亿元。企业销售房产完毕，取得收入49亿元。企业缴纳土地增值税计算方法如下。
收入额：49亿元
扣除项目：（1）取得土地使用权：0.3亿元
（2）房地产开发成本：15.4亿元
（3）房地产开发费用：2亿元
（4）营业税、城建税和教育费附加：2.695亿元
（5）其他扣除额：3.14亿元
（6）合计：23.535亿元
（7）应纳土地增值税
①
②增值额=49-23.535=25.465（亿元）
③应纳土地增值税=25.465×50%-23.535×15%=9.20225（亿元）
要求：根据上述资料，企业在缴纳土地增值税时存在哪些问题，如有错误请计算应补缴的土地增值税额。
